Die Anerkennung wissenschaftlicher Erkenntnisse und die Schulung des logischen Denkens ist die Basis einer modernen Allgemeinbildung, wie sie im pädagogischen Leitbild der Schule verankert ist.

2018 erhielt die Mittelschule Mariapfarr erstmals das MINT-Gütesiegel für Schulen. MINT ist die Abkürzung für M(athematik), I(nformatik), N(aturwissenschaft) und T(echnik).

In der Stundentafel spiegelt sich dieser Schwerpunkt darin wider, dass allen unseren Schüler:innen eine große Zahl an Stunden in Mathematik, Geometrischem Zeichnen, Digitaler Grundbildung, Physik, Chemie, Biologie und Technischem Werken angeboten werden.

Besonders Interessierte erlangen im Rahmen des Alternativen Interessenfaches „Natur & Technik“ zusätzlich Kenntnisse in vertiefter Informatik, Robotik und Elektrotechnik, experimenteller Naturwissenschaft (Physik, Chemie, Biologie) und vertieftem Geometrischen Zeichnen.

Auch in „Natur & Technik“ verläuft der Unterricht teils projektorientiert und beschäftigt sich mit Themen, die die Biosphärenparkregion unmittelbar betreffen. (Beispiel: nachhaltige und ökologisch vertretbare Formen der Energiegewinnung.)